Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2010300C02RikE9Q3M9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2010300C02RikE9Q3M9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2010300C02RikE9Q3M9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms