Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms