Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms