Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700015F17RikD3YUK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700015F17RikD3YUK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms