Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptprz1B9EKR1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptprz1B9EKR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprz1B9EKR1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms