Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf11bB4XVQ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11bB4XVQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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