Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp26c1B2RXA7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp26c1B2RXA7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms