Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprbB2RU80 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtprbB2RU80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms