Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r5B2RQT2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r5B2RQT2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r5B2RQT2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r5B2RQT2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r5B2RQT2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms