Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trabd2bB1ATG9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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Trabd2bB1ATG9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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Trabd2bB1ATG9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trabd2bB1ATG9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trabd2bB1ATG9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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