Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Herc3A6H6S0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herc3A6H6S0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms