Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll9A2APC3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll9A2APC3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll9A2APC3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms