Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT7

Vmn1r3, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r3A2AMT7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r3A2AMT7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r3A2AMT7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r3A2AMT7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r3A2AMT7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r3A2AMT7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r3A2AMT7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r3A2AMT7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r3A2AMT7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r3A2AMT7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms