Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn3A2ALK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptpn3A2ALK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn3A2ALK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms