Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col9a3A2ACT7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a3A2ACT7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a3A2ACT7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms