Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdr2lA2A6T1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr2lA2A6T1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms