Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc166S4R181 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc166S4R181 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms