Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt27Q9Z320 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt27Q9Z320 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt27Q9Z320 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms