Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hdac5Q9Z2V6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hdac5Q9Z2V6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Hdac5Q9Z2V6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hdac5Q9Z2V6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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