Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Knop1Q9Z2Q2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Knop1Q9Z2Q2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knop1Q9Z2Q2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms