Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tulp1Q9Z273 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tulp1Q9Z273 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp1Q9Z273 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms