Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb6Q9Z0T9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms