Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ApipQ9WVQ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApipQ9WVQ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms