Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfc2Q9WUK4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfc2Q9WUK4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms