Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus1Q9WU56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pus1Q9WU56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus1Q9WU56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms