Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna6Q9R0W9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna6Q9R0W9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna6Q9R0W9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms