Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx8Q9QXV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx8Q9QXV1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms