Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms