Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN5

Prl3c1, Prolactin-3C1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3c1Q9QUN5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prl3c1Q9QUN5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prl3c1Q9QUN5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prl3c1Q9QUN5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms