Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SacsQ9JLC8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SacsQ9JLC8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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