Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgn5Q9JL35 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn5Q9JL35 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms