Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Extl1Q9JKV7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl1Q9JKV7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl1Q9JKV7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms