Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtofQ9ESF1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OtofQ9ESF1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.7 ms