Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4bQ9ES61 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms