Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx6Q9ER75 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx6Q9ER75 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Irx6Q9ER75 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms