Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clstn2Q9ER65 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Clstn2Q9ER65 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clstn2Q9ER65 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clstn2Q9ER65 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms