Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pold3Q9EQ28 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pold3Q9EQ28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pold3Q9EQ28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pold3Q9EQ28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold3Q9EQ28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold3Q9EQ28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms