Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr6Q9EPW9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr6Q9EPW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr6Q9EPW9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms