Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a1Q9EPE9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a1Q9EPE9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a1Q9EPE9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms