Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r53Q9EP93 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r53Q9EP93 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r53Q9EP93 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r53Q9EP93 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r53Q9EP93 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r53Q9EP93 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms