Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pak1ip1Q9DCE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pak1ip1Q9DCE5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms