Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xab2Q9DCD2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Xab2Q9DCD2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms