Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf6Q9DBU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms