Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Llcfc1Q9D9P8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Llcfc1Q9D9P8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Llcfc1Q9D9P8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms