Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34b2Q9D9N2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34b2Q9D9N2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34b2Q9D9N2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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