Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alg13Q9D8C3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alg13Q9D8C3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alg13Q9D8C3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms