Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MsraQ9D6Y7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MsraQ9D6Y7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MsraQ9D6Y7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms