Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab3Q9D6J4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Necab3Q9D6J4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab3Q9D6J4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms