Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atad1Q9D5T0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad1Q9D5T0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms