Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D5Q8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D5Q8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms